RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.38■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 NEUROD2Q15784 382 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC27Q2M243 656 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CRBNQ96SW2 442 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR63Q8IWG1 891 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 LTN1O94822 1766 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FCHSD2O94868 740 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SBNO1A3KN83 1393 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ALS2Q96Q42 1657 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 HMOX1P09601 288 aa26.34■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 NFAT5O94916 1531 aa26.34■■□□□ 1.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FLT4P35916 1363 aa26.33■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKAR2BP31323 418 aa26.32■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.31■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 AMPHP49418 695 aa26.29■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SLIT3O75094 1523 aa26.29■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.29■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.28■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXC9P31274 260 aa26.27■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 BRINP3Q76B58 766 aa26.27■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.27■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.27■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PXDNQ92626 1479 aa26.27■■□□□ 1.8
PACSIN3-211ENST00000539589 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 USP19O94966 1318 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SLAIN2Q9P270 581 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 BCAR3O75815 825 aa26.24■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GCP02774 474 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHG5O94827 1062 aa26.22■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 RIPK4P57078 832 aa26.22■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 RTL1A6NKG5 1358 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.2■■□□□ 1.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF10O15013 1369 aa26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 IP6K1Q92551 441 aa26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 EYA1Q99502 592 aa26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 NFE2L2Q16236 605 aa26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE3AQ14432 1141 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 KDRP35968 1356 aa26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 NEFMP07197 916 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 RGPD5Q99666 1765 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-211ENST00000539589 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 IL16Q14005 1332 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 COL18A1P39060 1754 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-211ENST00000539589 MS4A1P11836 297 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF4Q96M43 638 aa26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM83GA6ND36 823 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 DCTN1Q14203 1278 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 PANK1Q8TE04 598 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCA3Q99758 1704 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 AAMPQ13685 434 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 COG6Q9Y2V7 657 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 NCAPD2Q15021 1401 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF853P0CG23 659 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-211ENST00000539589 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
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