RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PACS2Q86VP3 889 aa8.01□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.01□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PADI6Q6TGC4 694 aa8□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AGLP35573 1532 aa8□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM198AQ9UFP1 575 aa8□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 E9PCH4 1651 aa7.99□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.99□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR37O15354 613 aa7.99□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HIC1Q14526 733 aa7.99□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.99□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTC13Q8NBP0 860 aa7.99□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIF1BO60333 1816 aa7.99□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBPF26B4DH59 902 aa7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MLECQ14165 292 aa7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.98□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.97□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRCH3Q96II8 777 aa7.97□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.97□□□□□ -1.13
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GNPATO15228 680 aa7.96□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PNMA3Q9UL41 463 aa7.96□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCC3O15438 1527 aa7.96□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TATDN2Q93075 761 aa7.95□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C3orf80F5H4A9 247 aa7.95□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMAPO00193 183 aa7.95□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PKDCCQ504Y2 493 aa7.95□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.95□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.94□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DGAT1O75907 488 aa7.94□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.94□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.94□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRPM2O94759 1503 aa7.93□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MROH2AA6NES4 1674 aa7.93□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.93□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.93□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.93□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FECHP22830 423 aa7.92□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IL21Q9HBE4 155 aa7.92□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.92□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPRTO14522 1441 aa7.92□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RGL3Q3MIN7 710 aa7.92□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.92□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.92□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLTCL1P53675 1640 aa7.91□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPATQ14207 1427 aa7.91□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POTECB2RU33 542 aa7.91□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GGCXP38435 758 aa7.9□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM161AQ3B820 660 aa7.9□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.9□□□□□ -1.14
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZMYM3Q14202 1370 aa7.9□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP4CP60510 307 aa7.89□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EYA1Q99502 592 aa7.89□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLA2R1Q13018 1463 aa7.89□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NOS1P29475 1434 aa7.88□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.88□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.88□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OATP04181 439 aa7.88□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP2K5Q13163 448 aa7.88□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C3P01024 1663 aa7.88□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.87□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WFS1O76024 890 aa7.87□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTRQ99707 1265 aa7.87□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ERVK-7P63135 1459 aa7.87□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNAJB2P25686 324 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIK3C2BO00750 1634 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SYNMO15061 1565 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IDI1Q13907 227 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEUROD2Q15784 382 aa7.86□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TNRQ92752 1358 aa7.85□□□□□ -1.15
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPLO60437 1756 aa7.85□□□□□ -1.15
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