RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533459.1

AP002989.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP002989.1, Length 562 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002989.1-201ENST00000533459 BRICD5Q6PL45 260 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 THAP11Q96EK4 314 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 UACAQ9BZF9 1416 aa6.67□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 GLI2P10070 1586 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 ATG7O95352 703 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 PPP4CP60510 307 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 LYPD8Q6UX82 237 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 FBXO41Q8TF61 875 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 WNT2BQ93097 391 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 UCN2Q96RP3 112 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 WBP1LQ9NX94 342 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 MAP10Q9P2G4 905 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 ADGRL1O94910 1474 aa6.66□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 CARNS1A5YM72 827 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 Q3C1V9 767 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.65□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AP002989.1-201ENST00000533459 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 RFX1P22670 979 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 DESI1Q6ICB0 168 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.64□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 TLL1O43897 1013 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 CUL7Q14999 1698 aa6.63□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.62□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 UNCXA6NJT0 531 aa6.62□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 COPS2P61201 443 aa6.62□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 TSPOAP1O95153 1857 aa6.62□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.61□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 POTEMA6NI47 508 aa6.61□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 FBXO45P0C2W1 286 aa6.61□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 JUNDP17535 347 aa6.61□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 PRR14Q9BWN1 585 aa6.61□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 CD109Q6YHK3 1445 aa6.6□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 SOX11P35716 441 aa6.6□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.6□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 STAC3Q96MF2 364 aa6.6□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 PIK3CDO00329 1044 aa6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 NR1I2O75469 434 aa6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 IQGAP2Q13576 1575 aa6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.59□□□□□ -1.35
AP002989.1-201ENST00000533459 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 PTPRNQ16849 979 aa6.58□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 CDCA8Q53HL2 280 aa6.58□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.58□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 SPSB2Q99619 263 aa6.58□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.58□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.58□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.58□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 CTHP32929 405 aa6.57□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 NR1H3Q13133 447 aa6.57□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 MSS51Q4VC12 460 aa6.57□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 GOLGA3Q08378 1498 aa6.57□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.57□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 DISP1Q96F81 1524 aa6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 ZBBXA8MT70 800 aa6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 ZNF516Q92618 1163 aa6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 MTRQ99707 1265 aa6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.56□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.55□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 MMP16P51512 607 aa6.55□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 SEMA3FQ13275 785 aa6.55□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.55□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.55□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.55□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 ATP9BO43861 1147 aa6.54□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 ZPR1O75312 459 aa6.54□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 KCNH2Q12809 1159 aa6.54□□□□□ -1.36
AP002989.1-201ENST00000533459 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms