RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522621.1

CLVS1-208, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLVS1, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-208ENST00000522621 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 SLAIN2Q9P270 581 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.32□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 GCP02774 474 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 FBLN1P23142 703 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 NWD1Q149M9 1564 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 SSH2Q76I76 1423 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 IP6K1Q92551 441 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 RTL1A6NKG5 1358 aa7.31□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 HOXC9P31274 260 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 IFT57Q9NWB7 429 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 ARHGEF10O15013 1369 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.3□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 PDE3AQ14432 1141 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 KIF1AQ12756 1690 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 PLEKHG5O94827 1062 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 CFAP44Q96MT7 982 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.28□□□□□ -1.24
CLVS1-208ENST00000522621 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 EYA1Q99502 592 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 SHPRHQ149N8 1683 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 KIF16BQ96L93 1317 aa7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 EVA1CP58658 441 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.26□□□□□ -1.25
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CLVS1-208ENST00000522621 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.26□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 TOM1O60784 492 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 SPG7Q9UQ90 795 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.25□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 PLIN1O60240 522 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 BCAR3O75815 825 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 TEFQ10587 303 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 BRINP3Q76B58 766 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 STK31Q9BXU1 1019 aa7.24□□□□□ -1.25
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CLVS1-208ENST00000522621 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 USP19O94966 1318 aa7.24□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 KDRP35968 1356 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 CRBNQ96SW2 442 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.23□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 PIK3C2AO00443 1686 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.22□□□□□ -1.25
CLVS1-208ENST00000522621 CHL1O00533 1208 aa7.22□□□□□ -1.25
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