RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 IRAK1P51617 712 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 RRAGCQ9HB90 399 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 H2AFB1P0C5Y9 115 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 H2AFB2P0C5Z0 115 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01559Q495D7 138 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM52Q96A61 297 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCANO14594 1321 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 NR5A1Q13285 461 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 JUNDP17535 347 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 DBN1Q16643 649 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 OGFOD2Q6N063 350 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF511Q8NB15 262 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF217Q8TC41 542 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 PXYLP1Q8TE99 480 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 EDARADDQ8WWZ3 215 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 BAP1Q92560 729 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUDT12Q9BQG2 462 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF112Q9ULX5 631 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPTLC1O15269 473 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTGDRQ13258 359 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q3C1V9 767 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM22Q8IYM9 498 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRRG2O14669 202 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 MX2P20592 715 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 PKD2Q13563 968 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZVU0 165 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM11Q96F44 468 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC93B1Q9H1C4 597 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 RSPH4AQ5TD94 716 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 RDH13Q8NBN7 331 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLRG1Q96E93 195 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 GMCL1Q96IK5 515 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBLBQ13191 982 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 POU5F2Q8N7G0 328 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIK3R2O00459 728 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP2K3P46734 347 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 C4orf48Q5BLP8 95 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM174AQ8TBP5 190 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 HLA-CQ95604 372 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 BTBD6Q96KE9 485 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARID5BQ14865 1188 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX11L8A8MPP1 907 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 THBS1P07996 1170 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD97P48960 835 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCMTD2Q9NV79 361 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAMTS4O75173 837 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNYL3P0C7X3 344 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 GP2P55259 537 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXJ1Q92949 421 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSPNO60542 156 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPXP11678 715 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMPD1P23109 780 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXR1Q6PIV2 292 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLVAPQ9BX97 442 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 EVA1BQ9NVM1 165 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 B8ZZF3 427 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2CD2LO14523 706 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 MED26O95402 600 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 FSHRP23945 695 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRIPAP1Q4V328 841 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGBL1Q96MI9 1066 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRERF1Q96PN7 1200 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 GGA1Q9UJY5 639 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 OATP04181 439 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSTR4P31391 388 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNH2Q12809 1159 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHSY3Q70JA7 882 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC116Q8IYX3 515 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADGRE2Q9UHX3 823 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHGAP10645 457 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHOQP17081 205 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 RELBQ01201 579 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-871P-201ENST00000516122 LILRA6Q6PI73 481 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms