RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514040.1

MCTP1-216, Transcript of multiple C2 and transmembrane domain containing 1, human

TSL 5

Gene MCTP1, Length 1,905 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCTP1-216	ENST00000514040	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MCTP1-216	ENST00000514040	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MCTP1-216	ENST00000514040	SH3BP2	P78314	561 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MCTP1-216	ENST00000514040	QPCT	Q16769	361 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MCTP1-216	ENST00000514040	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MCTP1-216	ENST00000514040	SOBP	A7XYQ1	873 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	LYPD8	Q6UX82	237 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	BAP1	Q92560	729 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	WHAMM	Q8TF30	809 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	MAP10	Q9P2G4	905 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	ZNF511	Q8NB15	262 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	PODN	Q7Z5L7	613 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	LILRB3	O75022	631 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	COBL	O75128	1261 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	MPND	Q8N594	471 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	ADH1C	P00326	375 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	FAM117A	Q9C073	453 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	AGER	Q15109	404 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	FOXJ1	Q92949	421 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MCTP1-216	ENST00000514040	FURIN	P09958	794 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	TIMP2	P16035	220 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	ARID5B	Q14865	1188 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	NNT	Q13423	1086 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	UPP2	O95045	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	NBPF14	Q5TI25	921 aa		5	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	NEUROD2	Q15784	382 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	AP1G2	O75843	785 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	SV2A	Q7L0J3	742 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	CDK15	Q96Q40	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	NR6A1	Q15406	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCTP1-216	ENST00000514040	FSHR	P23945	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	NR5A1	Q13285	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	NR3C2	P08235	984 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	BMP2	P12643	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	GRM5	P41594	1212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	PTS	Q03393	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	USP17L8	P0C7I0	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	RFC5	P40937	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCTP1-216	ENST00000514040	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms