RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.73□□□□□ -0.53
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.62□□□□□ -0.55
MSC-AS1-202ENST00000512290 NCOA2Q15596 1464 aa11.62□□□□□ -0.55
MSC-AS1-202ENST00000512290 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.61□□□□□ -0.55
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MSC-AS1-202ENST00000512290 SLIT1O75093 1534 aa11.6□□□□□ -0.55
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.59□□□□□ -0.55
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MSC-AS1-202ENST00000512290 COPS2P61201 443 aa11.57□□□□□ -0.56
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MSC-AS1-202ENST00000512290 RGS12O14924 1447 aa11.55□□□□□ -0.56
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MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR14Q9BWN1 585 aa11.55□□□□□ -0.56
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MSC-AS1-202ENST00000512290 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.55□□□□□ -0.56
MSC-AS1-202ENST00000512290 CEP152O94986 1710 aa11.54□□□□□ -0.56
MSC-AS1-202ENST00000512290 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.53□□□□□ -0.56
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.53□□□□□ -0.56
MSC-AS1-202ENST00000512290 TBX22Q9Y458 520 aa11.53□□□□□ -0.56
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MSC-AS1-202ENST00000512290 CEP162Q5TB80 1403 aa11.52□□□□□ -0.56
MSC-AS1-202ENST00000512290 RCCD1A6NED2 376 aa11.52□□□□□ -0.57
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MSC-AS1-202ENST00000512290 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.52□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.52□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.51□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.51□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q6ZNB5 142 aa11.51□□□□□ -0.57
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MSC-AS1-202ENST00000512290 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.51□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 SHPRHQ149N8 1683 aa11.51□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.5□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 TET3O43151 1660 aa11.5□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.5□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.5□□□□□ -0.57
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ZPR1O75312 459 aa11.49□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 GGCXP38435 758 aa11.49□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.47□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.47□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
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MSC-AS1-202ENST00000512290 OATP04181 439 aa11.47□□□□□ -0.57
MSC-AS1-202ENST00000512290 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
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