RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 NAT1P18440 290 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 ERBB3P21860 1342 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 SMAPO00193 183 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 FAM163BP0C2L3 166 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 ECEL1O95672 775 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 RWDD2BP57060 319 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 VEZTQ9HBM0 779 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 SUN2Q9UH99 717 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM66O15016 1216 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 E2F4Q16254 413 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 GORABQ5T7V8 394 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 SH3GL3Q99963 347 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.4□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 TPM1P09493 284 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 ATG3Q9NT62 314 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 KIF18AQ8NI77 898 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 KIF2CQ99661 725 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEA9P43362 315 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PSMD2Q13200 908 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 SMC2O95347 1197 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RASA3Q14644 834 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 SRLQ86TD4 932 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 OGFOD1Q8N543 542 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 TEX35Q5T0J7 233 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 WDR78Q5VTH9 848 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 OATP04181 439 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PACS2Q86VP3 889 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 FAM177BA6PVY3 158 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 C21orf2O43822 256 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 NEBLO76041 1014 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PPM1EQ8WY54 764 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 EVI5LQ96CN4 794 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 GBP4Q96PP9 640 aa7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 MYBL2P10244 700 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 MCM6Q14566 821 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 NLRP13Q86W25 1043 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 WDR97A6NE52 1622 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 NESP48681 1621 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 CDKL5O76039 1030 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 MIEF2Q96C03 454 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 LONRF3Q496Y0 759 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-216ENST00000507116 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.35□□□□□ -1.23
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