RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.99■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 POLKQ9UBT6 870 aa20.99■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.99■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.98■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 BCAR3O75815 825 aa20.98■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.97■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 SSH2Q76I76 1423 aa20.96■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 NWD1Q149M9 1564 aa20.96■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 CCDC27Q2M243 656 aa20.96■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.95■□□□□ 0.95
SYP-208ENST00000494396 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 NEUROD2Q15784 382 aa20.95■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 FBLN1P23142 703 aa20.95■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 MRE11P49959 708 aa20.95■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 MCM4P33991 863 aa20.94■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 SEC24BO95487 1268 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 WDR63Q8IWG1 891 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.93■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 C14orf37Q86TY3 774 aa20.92■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.92■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.92■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.91■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.9■□□□□ 0.94
SYP-208ENST00000494396 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.89■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 PTMSP20962 102 aa20.88■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 COG6Q9Y2V7 657 aa20.88■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 USP31Q70CQ4 1352 aa20.88■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 HSPA2P54652 639 aa20.87■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 FCHSD2O94868 740 aa20.86■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 IL13P35225 146 aa20.84■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 PANK1Q8TE04 598 aa20.84■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 TRAK2O60296 914 aa20.84■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.84■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.83■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.83■□□□□ 0.93
SYP-208ENST00000494396 PIK3C2AO00443 1686 aa20.83■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.82■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.82■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.82■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 NLRP6P59044 892 aa20.81■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.81■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.8■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 ABTB2Q8N961 1025 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 SOX12O15370 315 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 PRKAR2BP31323 418 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 PSME1Q06323 249 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.79■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.77■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 TMEM94Q12767 1356 aa20.77■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 ESPNB1AK53 854 aa20.77■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 HMOX1P09601 288 aa20.77■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 RIPK4P57078 832 aa20.77■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 HSCBQ8IWL3 235 aa20.77■□□□□ 0.92
SYP-208ENST00000494396 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.77■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 USP54Q70EL1 1684 aa20.76■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 IL16Q14005 1332 aa20.76■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 SNX21Q969T3 373 aa20.76■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 ORAI2Q96SN7 254 aa20.76■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 SBNO1A3KN83 1393 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 PEAK1Q9H792 1746 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 TPM2P07951 284 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 FLT4P35916 1363 aa20.75■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.74■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 ATF3P18847 181 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms