RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489337.5

SMTN-218, Transcript of smoothelin, humanhuman

TSL 2

Gene SMTN, Length 3,560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTN-218ENST00000489337 WWC1Q8IX03 1113 aa14.69□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.69□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.68□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.68□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 HSCBQ8IWL3 235 aa14.68□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 RUNDC1Q96C34 613 aa14.68□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 NGEFQ8N5V2 710 aa14.67□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 MCM10Q7L590 875 aa14.67□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.67□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.66□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 ADGRB1O14514 1584 aa14.66□□□□□ -0.06
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SMTN-218ENST00000489337 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.66□□□□□ -0.06
SMTN-218ENST00000489337 CHRNA2Q15822 529 aa14.65□□□□□ -0.06
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SMTN-218ENST00000489337 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.65□□□□□ -0.06
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SMTN-218ENST00000489337 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.63□□□□□ -0.07
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SMTN-218ENST00000489337 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.56□□□□□ -0.08
SMTN-218ENST00000489337 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.56□□□□□ -0.08
SMTN-218ENST00000489337 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.56□□□□□ -0.08
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SMTN-218ENST00000489337 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.55□□□□□ -0.08
SMTN-218ENST00000489337 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.54□□□□□ -0.08
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SMTN-218ENST00000489337 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.54□□□□□ -0.08
SMTN-218ENST00000489337 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.54□□□□□ -0.08
SMTN-218ENST00000489337 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SMTN-218ENST00000489337 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.54□□□□□ -0.08
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SMTN-218ENST00000489337 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SMTN-218ENST00000489337 PTMSP20962 102 aa14.53□□□□□ -0.08
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SMTN-218ENST00000489337 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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SMTN-218ENST00000489337 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
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SMTN-218ENST00000489337 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.51□□□□□ -0.09
SMTN-218ENST00000489337 ANXA1P04083 346 aa14.51□□□□□ -0.09
SMTN-218ENST00000489337 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SMTN-218ENST00000489337 SMC5Q8IY18 1101 aa14.51□□□□□ -0.09
SMTN-218ENST00000489337 CPS1P31327 1500 aa14.51□□□□□ -0.09
SMTN-218ENST00000489337 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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