RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 MCM2P49736 904 aa12.02□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 RNF214Q8ND24 703 aa12.02□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 TRIM34Q9BYJ4 488 aa12.02□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 PANK2Q9BZ23 570 aa12.02□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.02□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ATP10BO94823 1461 aa12.01□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 MCM5P33992 734 aa12.01□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.01□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.01□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa12.01□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 NFXL1Q6ZNB6 911 aa12.01□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 CHD1LQ86WJ1 897 aa12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 KLHL34Q8N239 644 aa12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ZNF428Q96B54 188 aa12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 SMC3Q9UQE7 1217 aa12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 SASS6Q6UVJ0 657 aa12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 FSD1Q9BTV5 496 aa11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 PDE4CQ08493 712 aa11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 CCDC27Q2M243 656 aa11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 BICD2Q8TD16 824 aa11.99□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ERICH2A1L162 156 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 GNAI2P04899 355 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 CABP4P57796 275 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ADGRL1O94910 1474 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 DYNC1I1O14576 645 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 FYB1O15117 783 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 DISP1Q96F81 1524 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 FOSBP53539 338 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 IDI1Q13907 227 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 ASXL2Q76L83 1435 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 CNTROBQ8N137 903 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-209ENST00000446688 CEP170Q5SW79 1584 aa11.96□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 FCHSD2O94868 740 aa11.96□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 HS1BP3Q53T59 392 aa11.96□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.96□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 CCDC66A2RUB6 948 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 SNX21Q969T3 373 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 OFD1O75665 1012 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 SPG7Q9UQ90 795 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 ABCC2Q92887 1545 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 MYL6BP14649 208 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 NEK4P51957 841 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 CEP89Q96ST8 783 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 FANCAO15360 1455 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 SSFA2P28290 1259 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 TAF3Q5VWG9 929 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 SIL1Q9H173 461 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 MTMR7Q9Y216 660 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 FOXO3O43524 673 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 SEC24BO95487 1268 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 BAG4O95429 457 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 IFT57Q9NWB7 429 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 PLCH2O75038 1416 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-209ENST00000446688 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms