RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC30AQ86WT1 665 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 FANCAO15360 1455 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 MORC1Q86VD1 984 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCA6Q8N139 1617 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL33A6NCF5 533 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 UVSSAQ2YD98 709 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 TIGD1Q96MW7 591 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHDP01880 384 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 UQCRHP07919 91 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-202ENST00000380828 NRDCO43847 1150 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 LMNB1P20700 586 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP2R5AQ15172 486 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 UNCXA6NJT0 531 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 OFD1O75665 1012 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE6BP35913 854 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 SETDB1Q15047 1291 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 CXorf38Q8TB03 319 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP162Q5TB80 1403 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 MKL1Q969V6 931 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB11FIP3O75154 756 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRMP28827 1452 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP10AO60312 1499 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 C3P01024 1663 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 MECOMQ03112 1051 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 GORABQ5T7V8 394 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 NBPF3Q9H094 633 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 RMI1Q9H9A7 625 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 SMAPO00193 183 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCD1P33897 745 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 TERF1P54274 439 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 GYS2P54840 703 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 NEUROD2Q15784 382 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 PHC3Q8NDX5 983 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 CLIP1P30622 1438 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL10Q8N8L6 244 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 TIAM1Q13009 1591 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ICE2Q659A1 982 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ANP32CO43423 234 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 TPM3P06753 285 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 ARMC3Q5W041 872 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 GUCY2CP25092 1073 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 JMYQ8N9B5 988 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-202ENST00000380828 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.34□□□□□ -1.07
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