RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 ESPNB1AK53 854 aa17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC192P0DO97 292 aa17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1-201ENST00000366959 SART3Q15020 963 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1-201ENST00000366959 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
RPS6KC1-201ENST00000366959 NAIPQ13075 1403 aa17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 HIP1O00291 1037 aa17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAP7D2Q96T17 732 aa17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 CNNM1Q9NRU3 951 aa17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 TIAM1Q13009 1591 aa17.01■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 KRT85P78386 507 aa17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 NSD3Q9BZ95 1437 aa17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 AACSQ86V21 672 aa17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 AK7Q96M32 723 aa17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 MCM10Q7L590 875 aa17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 SERPINC1P01008 464 aa17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACBD3Q9H3P7 528 aa17■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 EPS15P42566 896 aa16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 FERMT3Q86UX7 667 aa16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLHL34Q8N239 644 aa16.99■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYCE3A1L190 88 aa16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDRG1Q9NUG6 133 aa16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 CABP4P57796 275 aa16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 DDX11Q96FC9 970 aa16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 FCHSD2O94868 740 aa16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1-201ENST00000366959 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 UQCRHP07919 91 aa16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 NFE2L2Q16236 605 aa16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPATA32Q96LK8 384 aa16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC112Q8NEF3 446 aa16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD1Q15327 319 aa16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 BTBD11A6QL63 1104 aa16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAMK4Q16566 473 aa16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 JMYQ8N9B5 988 aa16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 F6X3S4 739 aa16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 CASTP20810 708 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 H0YHG0 523 aa16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 ODF2Q5BJF6 829 aa16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDR1P51861 262 aa16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMARCE1Q969G3 411 aa16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP2B2Q01814 1243 aa16.91■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.91■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 TXLNAP40222 546 aa16.91■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.91■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.91■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.91■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 TOPBP1Q92547 1522 aa16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.9■□□□□ 0.3
RPS6KC1-201ENST00000366959 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms