RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ITPRIPQ8IWB1 547 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRD-201ENST00000355233 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 SETSIPP0DME0 302 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 TEFQ10587 303 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 STIM1Q13586 685 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 CLUL1Q15846 466 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC112Q8NEF3 446 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 TSPY26PQ9H489 355 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
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PTPRD-201ENST00000355233 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
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PTPRD-201ENST00000355233 ARID3AQ99856 593 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRD-201ENST00000355233 CCDC38Q502W7 563 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 KANK3Q6NY19 840 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.79□□□□□ -1.48
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