RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 LTN1O94822 1766 aa8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 NUDCQ9Y266 331 aa8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.99□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 PXDNQ92626 1479 aa7.99□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 SLIT3O75094 1523 aa7.99□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 NFAT5O94916 1531 aa7.99□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 SLAIN2Q9P270 581 aa7.99□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 SOX12O15370 315 aa7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 BRINP3Q76B58 766 aa7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 SBNO1A3KN83 1393 aa7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 IL13P35225 146 aa7.97□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.97□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.97□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 RUNDC1Q96C34 613 aa7.97□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.97□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 USP19O94966 1318 aa7.96□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 FLT4P35916 1363 aa7.96□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.96□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 APAF1O14727 1248 aa7.96□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.96□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.96□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ZMYND15Q9H091 742 aa7.96□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.95□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 RTL1A6NKG5 1358 aa7.95□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 AMPHP49418 695 aa7.95□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.95□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.95□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 AAMPQ13685 434 aa7.95□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.95□□□□□ -1.14
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CCR6-201ENST00000341935 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 FCHSD2O94868 740 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 PDE3BQ13370 1112 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 NGEFQ8N5V2 710 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF10O15013 1369 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 GCP02774 474 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ZNF521Q96K83 1311 aa7.94□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ABCA3Q99758 1704 aa7.93□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 HMOX1P09601 288 aa7.93□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.93□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 PRKAR2BP31323 418 aa7.92□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 IP6K1Q92551 441 aa7.92□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 RGPD5Q99666 1765 aa7.92□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.92□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.92□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.92□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 RGPD2P0DJD1 1756 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 NEUROD2Q15784 382 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 COL18A1P39060 1754 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 CCDC27Q2M243 656 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 WWC1Q8IX03 1113 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 ABCC6O95255 1503 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 NEFMP07197 916 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA2Q08379 1002 aa7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.9□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.9□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.9□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 PHLPP1O60346 1717 aa7.9□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.9□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.9□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 EYA1Q99502 592 aa7.9□□□□□ -1.14
CCR6-201ENST00000341935 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.9□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 KDRP35968 1356 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 SLFN5Q08AF3 891 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 RIPK4P57078 832 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 NFE2L2Q16236 605 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 WDR63Q8IWG1 891 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 FBXO3Q9UK99 471 aa7.88□□□□□ -1.15
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