RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPYL6Q8N831 410 aa26.95■■□□□ 1.91
PTDSS1-201ENST00000337004 MBIPQ9NS73 344 aa26.95■■□□□ 1.91
PTDSS1-201ENST00000337004 PTCH1Q13635 1447 aa26.95■■□□□ 1.91
PTDSS1-201ENST00000337004 MCM4P33991 863 aa26.95■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.94■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 AGLP35573 1532 aa26.94■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 COG3Q96JB2 828 aa26.94■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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PTDSS1-201ENST00000337004 CFAP44Q96MT7 982 aa26.93■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.92■■□□□ 1.9
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PTDSS1-201ENST00000337004 SNX21Q969T3 373 aa26.91■■□□□ 1.9
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PTDSS1-201ENST00000337004 ABCC4O15439 1325 aa26.91■■□□□ 1.9
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.91■■□□□ 1.9
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PTDSS1-201ENST00000337004 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.89■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 SIRT1Q96EB6 747 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 METP08581 1390 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.87■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.86■■□□□ 1.89
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PTDSS1-201ENST00000337004 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.84■■□□□ 1.89
PTDSS1-201ENST00000337004 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.82■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.82■■□□□ 1.88
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PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.81■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.81■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 TRAK2O60296 914 aa26.81■■□□□ 1.88
PTDSS1-201ENST00000337004 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.81■■□□□ 1.88
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PTDSS1-201ENST00000337004 KIF2CQ99661 725 aa26.76■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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PTDSS1-201ENST00000337004 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
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PTDSS1-201ENST00000337004 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.71■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 GBP4Q96PP9 640 aa26.71■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 CHL1O00533 1208 aa26.7■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.7■■□□□ 1.87
PTDSS1-201ENST00000337004 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.7■■□□□ 1.86
PTDSS1-201ENST00000337004 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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PTDSS1-201ENST00000337004 C3P01024 1663 aa26.68■■□□□ 1.86
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PTDSS1-201ENST00000337004 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.64■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 AKAP12Q02952 1782 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.63■■□□□ 1.85
PTDSS1-201ENST00000337004 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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PTDSS1-201ENST00000337004 KRT24Q2M2I5 525 aa26.63■■□□□ 1.85
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