RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.33■■□□□ 1.81
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SUMO3-201ENST00000332859 SLFN5Q08AF3 891 aa26.32■■□□□ 1.8
SUMO3-201ENST00000332859 RTL1A6NKG5 1358 aa26.31■■□□□ 1.8
SUMO3-201ENST00000332859 SLIT3O75094 1523 aa26.31■■□□□ 1.8
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SUMO3-201ENST00000332859 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.23■■□□□ 1.79
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SUMO3-201ENST00000332859 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.19■■□□□ 1.78
SUMO3-201ENST00000332859 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.19■■□□□ 1.78
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SUMO3-201ENST00000332859 KDRP35968 1356 aa26.17■■□□□ 1.78
SUMO3-201ENST00000332859 EYA1Q99502 592 aa26.16■■□□□ 1.78
SUMO3-201ENST00000332859 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.16■■□□□ 1.78
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SUMO3-201ENST00000332859 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.15■■□□□ 1.78
SUMO3-201ENST00000332859 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.15■■□□□ 1.78
SUMO3-201ENST00000332859 PLEKHG5O94827 1062 aa26.14■■□□□ 1.78
SUMO3-201ENST00000332859 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.14■■□□□ 1.78
SUMO3-201ENST00000332859 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
SUMO3-201ENST00000332859 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.14■■□□□ 1.77
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SUMO3-201ENST00000332859 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-201ENST00000332859 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-201ENST00000332859 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-201ENST00000332859 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.02■■□□□ 1.76
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SUMO3-201ENST00000332859 NBPF4Q96M43 638 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-201ENST00000332859 CPDO75976 1380 aa26.02■■□□□ 1.76
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SUMO3-201ENST00000332859 IFT57Q9NWB7 429 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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SUMO3-201ENST00000332859 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 NCAPD2Q15021 1401 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 COL18A1P39060 1754 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 GNAI1P63096 354 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 FAM83GA6ND36 823 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 RGPD5Q99666 1765 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-201ENST00000332859 ERBB3P21860 1342 aa25.97■■□□□ 1.75
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SUMO3-201ENST00000332859 KIAA0232Q92628 1395 aa25.96■■□□□ 1.75
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SUMO3-201ENST00000332859 ZNF853P0CG23 659 aa25.95■■□□□ 1.75
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SUMO3-201ENST00000332859 DCTN1Q14203 1278 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-201ENST00000332859 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-201ENST00000332859 CFAP44Q96MT7 982 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-201ENST00000332859 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-201ENST00000332859 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SUMO3-201ENST00000332859 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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