RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 CDK19Q9BWU1 502 aa31.45■■■□□ 2.63
SENP3-201ENST00000321337 RAPGEF3O95398 923 aa31.45■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 MBIPQ9NS73 344 aa31.45■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa31.44■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
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SENP3-201ENST00000321337 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.42■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 NFE2L2Q16236 605 aa31.42■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 PIK3R4Q99570 1358 aa31.42■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 C8orf58Q8NAV2 365 aa31.41■■■□□ 2.62
SENP3-201ENST00000321337 ABCC4O15439 1325 aa31.41■■■□□ 2.62
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SENP3-201ENST00000321337 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa31.4■■■□□ 2.62
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SENP3-201ENST00000321337 ZFYVE9O95405 1425 aa31.34■■■□□ 2.61
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SENP3-201ENST00000321337 IFT57Q9NWB7 429 aa31.33■■■□□ 2.61
SENP3-201ENST00000321337 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.32■■■□□ 2.6
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SENP3-201ENST00000321337 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.3■■■□□ 2.6
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SENP3-201ENST00000321337 IL13P35225 146 aa31.29■■■□□ 2.6
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SENP3-201ENST00000321337 KRT24Q2M2I5 525 aa31.28■■■□□ 2.6
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SENP3-201ENST00000321337 LMBRD1Q9NUN5 540 aa31.25■■■□□ 2.59
SENP3-201ENST00000321337 CFAP44Q96MT7 982 aa31.24■■■□□ 2.59
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SENP3-201ENST00000321337 ZSCAN30Q86W11 494 aa31.19■■■□□ 2.58
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SENP3-201ENST00000321337 ANKRD44Q8N8A2 993 aa31.16■■■□□ 2.58
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SENP3-201ENST00000321337 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
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SENP3-201ENST00000321337 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
SENP3-201ENST00000321337 CEP85Q6P2H3 762 aa31.15■■■□□ 2.58
SENP3-201ENST00000321337 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
SENP3-201ENST00000321337 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
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