RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 V9GYY5 206 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
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CCNDBP1-201ENST00000300213 AFAP1Q8N556 730 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP48Q86UV5 1035 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.81■□□□□ 0.44
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PIBF1Q8WXW3 757 aa17.81■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 MCCP23508 829 aa17.8■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa17.79■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTC22Q5TAA0 569 aa17.79■□□□□ 0.44
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DCTN1Q14203 1278 aa17.79■□□□□ 0.44
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCC2Q92887 1545 aa17.78■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERC2O15083 957 aa17.78■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF20AO95235 890 aa17.78■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 CAMK4Q16566 473 aa17.78■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.78■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNPY2Q9Y2B0 182 aa17.78■□□□□ 0.44
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CCNDBP1-201ENST00000300213 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 PYCARDQ9ULZ3 195 aa17.77■□□□□ 0.43
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CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa17.75■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.75■□□□□ 0.43
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.75■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.75■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 SOX12O15370 315 aa17.75■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa17.75■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 DISP1Q96F81 1524 aa17.74■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.73■□□□□ 0.43
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CCNDBP1-201ENST00000300213 AEBP1Q8IUX7 1158 aa17.73■□□□□ 0.43
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CCNDBP1-201ENST00000300213 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa17.72■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM83GA6ND36 823 aa17.72■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 NECTIN2Q92692 538 aa17.72■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB9Q96C00 473 aa17.72■□□□□ 0.43
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.71■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT24Q2M2I5 525 aa17.71■□□□□ 0.43
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLEC17AQ6ZS10 378 aa17.71■□□□□ 0.43
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC112Q8NEF3 446 aa17.7■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 PALD1Q9ULE6 856 aa17.7■□□□□ 0.42
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.69■□□□□ 0.42
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ALDH1L2Q3SY69 923 aa17.69■□□□□ 0.42
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CCNDBP1-201ENST00000300213 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.68■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHACTR3Q96KR7 559 aa17.68■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUP160Q12769 1436 aa17.68■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMC3Q9UQE7 1217 aa17.68■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.68■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 EVC2Q86UK5 1308 aa17.67■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 CERS3Q8IU89 383 aa17.67■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.67■□□□□ 0.42
CCNDBP1-201ENST00000300213 BRD1O95696 1058 aa17.67■□□□□ 0.42
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