RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 GLI2P10070 1586 aa23.92■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 GCC1Q96CN9 775 aa23.91■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 MBD3O95983 291 aa23.91■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 ANKRD7Q92527 254 aa23.91■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.91■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.9■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.9■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.9■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.89■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 USP25Q9UHP3 1055 aa23.89■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.89■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 TAF3Q5VWG9 929 aa23.89■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.88■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 ATP10BO94823 1461 aa23.88■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.86■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 CFAP53Q96M91 514 aa23.86■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.85■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 ADCY5O95622 1261 aa23.85■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.85■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 CD109Q6YHK3 1445 aa23.84■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.84■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 ST18O60284 1047 aa23.83■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
GFI1-201ENST00000294702 ABCC11Q96J66 1382 aa23.82■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 UVSSAQ2YD98 709 aa23.81■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 FEZ1Q99689 392 aa23.81■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.81■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 ADGRB2O60241 1585 aa23.81■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.8■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 OGFRQ9NZT2 677 aa23.8■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 BRD1O95696 1058 aa23.8■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 PTPRTO14522 1441 aa23.8■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.79■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.79■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.79■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 MED14O60244 1454 aa23.78■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.78■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.78■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.78■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 SLFN14P0C7P3 912 aa23.78■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 TTC22Q5TAA0 569 aa23.78■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 CLTCL1P53675 1640 aa23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 ADGRL1O94910 1474 aa23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
GFI1-201ENST00000294702 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.77■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.76■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 TMX3Q96JJ7 454 aa23.75■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.75■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 IL16Q14005 1332 aa23.74■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 KCNJ4P48050 445 aa23.74■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 PHF14O94880 888 aa23.73■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 AP5Z1O43299 807 aa23.72■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 USP48Q86UV5 1035 aa23.72■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 KDM4AO75164 1064 aa23.72■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.72■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 SDSP20132 328 aa23.71■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 REREQ9P2R6 1566 aa23.71■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 DIP2BQ9P265 1576 aa23.7■■□□□ 1.39
GFI1-201ENST00000294702 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.7■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 NEK4P51957 841 aa23.69■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 CFAP44Q96MT7 982 aa23.69■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.68■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 PLCB2Q00722 1185 aa23.68■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 PREX2Q70Z35 1606 aa23.67■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.67■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 TRPM2O94759 1503 aa23.67■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 PIK3R4Q99570 1358 aa23.67■■□□□ 1.38
GFI1-201ENST00000294702 DCTPP1Q9H773 170 aa23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 204.4 ms