RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.86■■□□□ 1.57
CYGB-201ENST00000293230 C8orf34Q49A92 452 aa24.85■■□□□ 1.57
CYGB-201ENST00000293230 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.84■■□□□ 1.57
CYGB-201ENST00000293230 NFE2L2Q16236 605 aa24.84■■□□□ 1.57
CYGB-201ENST00000293230 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.84■■□□□ 1.57
CYGB-201ENST00000293230 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CYGB-201ENST00000293230 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.83■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 DIP2AQ14689 1571 aa24.82■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 NEFMP07197 916 aa24.82■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 FAM161AQ3B820 660 aa24.82■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 TBX22Q9Y458 520 aa24.82■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 USP6P35125 1406 aa24.82■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.81■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 TRIM27P14373 513 aa24.81■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 AAMPQ13685 434 aa24.81■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.81■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.8■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 PTCH1Q13635 1447 aa24.8■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.78■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.77■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 STRCQ7RTU9 1775 aa24.77■■□□□ 1.56
CYGB-201ENST00000293230 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 PEAK1Q9H792 1746 aa24.76■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 SSH2Q76I76 1423 aa24.76■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.76■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.73■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 USP31Q70CQ4 1352 aa24.71■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 FAM83GA6ND36 823 aa24.71■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.71■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.71■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 KIF16BQ96L93 1317 aa24.71■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 ZNF853P0CG23 659 aa24.7■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 IFT57Q9NWB7 429 aa24.7■■□□□ 1.55
CYGB-201ENST00000293230 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.7■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 TSPYL6Q8N831 410 aa24.7■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 MBIPQ9NS73 344 aa24.7■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 KCNA6P17658 529 aa24.69■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 PIK3R4Q99570 1358 aa24.69■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 SOX12O15370 315 aa24.69■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 GNAI1P63096 354 aa24.69■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.69■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.68■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.68■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.68■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.68■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 VAMP4O75379 141 aa24.67■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 DCTN1Q14203 1278 aa24.67■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.65■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.65■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 ZNF428Q96B54 188 aa24.65■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 PIK3C2AO00443 1686 aa24.64■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 CFAP44Q96MT7 982 aa24.64■■□□□ 1.54
CYGB-201ENST00000293230 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 NBR1Q14596 966 aa24.64■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.63■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.63■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.62■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.62■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.61■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.61■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 SEC24BO95487 1268 aa24.59■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.59■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.58■■□□□ 1.53
CYGB-201ENST00000293230 USP19O94966 1318 aa24.58■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 NWD1Q149M9 1564 aa24.58■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 SBNO1A3KN83 1393 aa24.56■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 FLT4P35916 1363 aa24.56■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 MCM10Q7L590 875 aa24.55■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 ARHGEF10O15013 1369 aa24.55■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 SLC4A3P48751 1232 aa24.54■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.54■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 SMC5Q8IY18 1101 aa24.53■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 KRT24Q2M2I5 525 aa24.52■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 ABCC4O15439 1325 aa24.52■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 NLRP6P59044 892 aa24.52■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.52■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 IL27Q8NEV9 243 aa24.52■■□□□ 1.52
CYGB-201ENST00000293230 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms