RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 STK32BQ9NY57 414 aa15.28■□□□□ 0.04
USP41-201ENST00000292729 PROM2Q8N271 834 aa15.27■□□□□ 0.04
USP41-201ENST00000292729 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
USP41-201ENST00000292729 MTFR1LQ9H019 292 aa15.27■□□□□ 0.04
USP41-201ENST00000292729 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
USP41-201ENST00000292729 UTRNP46939 3433 aa15.27■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 COL18A1P39060 1754 aa15.26■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.26■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 SLC15A2Q16348 729 aa15.26■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.26■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 SLIT3O75094 1523 aa15.26■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 TXNRD1Q16881 649 aa15.25■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 IFFO2Q5TF58 517 aa15.24■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.24■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.24■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 MAP3K5Q99683 1374 aa15.24■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.23■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.23■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 RGPD5Q99666 1765 aa15.22■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.22■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 NLRP6P59044 892 aa15.22■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 ARXQ96QS3 562 aa15.21■□□□□ 0.03
USP41-201ENST00000292729 USP6P35125 1406 aa15.2■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 NHSQ6T4R5 1651 aa15.2■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.19■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 EXOC5O00471 708 aa15.19■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.19■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.19■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 PIK3C2AO00443 1686 aa15.19■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 PAPPAQ13219 1627 aa15.17■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.17■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.17■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.17■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.17■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 CCDC7Q96M83 1385 aa15.16■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 GPR162Q16538 588 aa15.16■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 TNS2Q63HR2 1409 aa15.16■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.15■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.15■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.15■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.15■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 CABP2Q9NPB3 220 aa15.15■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 ABCC6O95255 1503 aa15.15■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 BTAF1O14981 1849 aa15.15■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP41-201ENST00000292729 CABP1Q9NZU7 370 aa15.14■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.13■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.1■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 POLD1P28340 1107 aa15.1■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.1■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 NFAT5O94916 1531 aa15.09■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.09■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.09■□□□□ 0.01
USP41-201ENST00000292729 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.08■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 ZNF827Q17R98 1081 aa15.07■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.07■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 EVC2Q86UK5 1308 aa15.07■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 GRIN3BO60391 1043 aa15.06■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 KLHL34Q8N239 644 aa15.06■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 AKT1S1Q96B36 256 aa15.06■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.06■□□□□ 0
USP41-201ENST00000292729 SOX12O15370 315 aa15.05■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 IL2RBP14784 551 aa15.05■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.05■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 USP54Q70EL1 1684 aa15.05■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 LTN1O94822 1766 aa15.05■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 ERBB3P21860 1342 aa15.04■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.03■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.03■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.02■□□□□ -0
USP41-201ENST00000292729 LY75O60449 1722 aa15.02□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 CEP350Q5VT06 3117 aa15.01□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.01□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.01□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 USP31Q70CQ4 1352 aa15□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 ATP10DQ9P241 1426 aa14.98□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 HSPA6P17066 643 aa14.97□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.97□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.97□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP41-201ENST00000292729 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.95□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.93□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 ADCY9O60503 1353 aa14.93□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 MSH5O43196 834 aa14.92□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP41-201ENST00000292729 KCNQ4P56696 695 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms