RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268082.4

CCDC33-201, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC33, Length 2,093 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-201ENST00000268082 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.09■□□□□ 0.17
CCDC33-201ENST00000268082 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC33-201ENST00000268082 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CCDC33-201ENST00000268082 PRKAR2BP31323 418 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 NFKBIBQ15653 356 aa16.08■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 SLC4A3P48751 1232 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 NFE2L2Q16236 605 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 PTCH1Q13635 1447 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 SLIT1O75093 1534 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 SEC24BO95487 1268 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 PIK3R4Q99570 1358 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 IL13P35225 146 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 BECN1Q14457 450 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.06■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 ITPRIPQ8IWB1 547 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 SMC5Q8IY18 1101 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 EID1Q9Y6B2 187 aa16.05■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.04■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 IFT57Q9NWB7 429 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 GNAI1P63096 354 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 NME9Q86XW9 330 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.03■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.02■□□□□ 0.16
CCDC33-201ENST00000268082 CERKQ8TCT0 537 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 COG3Q96JB2 828 aa16.02■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 ZNF853P0CG23 659 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 PHACTR3Q96KR7 559 aa16■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 PEAK1Q9H792 1746 aa16■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 OVOS2Q6IE36 1432 aa16■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 VAMP4O75379 141 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 HMOX1P09601 288 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 FBLN1P23142 703 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 GSE1Q14687 1217 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 ABCC4O15439 1325 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 CFAP44Q96MT7 982 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 DIP2AQ14689 1571 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 NUCB1Q02818 461 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC33-201ENST00000268082 USP54Q70EL1 1684 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 MBIPQ9NS73 344 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 USP6P35125 1406 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 USP31Q70CQ4 1352 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 GCC1Q96CN9 775 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 SSH2Q76I76 1423 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.93■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 TSPYL6Q8N831 410 aa15.92■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 CACNA1FO60840 1977 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 CHD1LQ86WJ1 897 aa15.91■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 PTPRUQ92729 1446 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 ACEP12821 1306 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 PIK3C2AO00443 1686 aa15.9■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCDC33-201ENST00000268082 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCDC33-201ENST00000268082 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCDC33-201ENST00000268082 KIAA0232Q92628 1395 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC33-201ENST00000268082 LRRC37A3O60309 1634 aa15.89■□□□□ 0.13
CCDC33-201ENST00000268082 BMP2KLQ5H9B9 411 aa15.88■□□□□ 0.13
CCDC33-201ENST00000268082 FBXO41Q8TF61 875 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 662 ms