RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.97■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.97■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.97■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 NLRP6P59044 892 aa16.97■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 AK9Q5TCS8 1911 aa16.97■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 TNRQ92752 1358 aa16.97■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 CLCN1P35523 988 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 NFE2L2Q16236 605 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 GRPEL1Q9HAV7 217 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC5-201ENST00000264350 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.96■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 NSD2O96028 1365 aa16.95■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 PIK3C2BO00750 1634 aa16.95■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 ZNF428Q96B54 188 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 DDIT3P35638 169 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 CHD1LQ86WJ1 897 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 FOXO3O43524 673 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 MBIPQ9NS73 344 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 PPLO60437 1756 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 KIF2CQ99661 725 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 GNAI1P63096 354 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 ABTB2Q8N961 1025 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 PTPRMP28827 1452 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 SMC5Q8IY18 1101 aa16.9■□□□□ 0.3
HERC5-201ENST00000264350 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.89■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 ALKQ9UM73 1620 aa16.89■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 ESPNB1AK53 854 aa16.89■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.89■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 IL13P35225 146 aa16.89■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 MRE11P49959 708 aa16.89■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.89■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.89■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 VAMP4O75379 141 aa16.88■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
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HERC5-201ENST00000264350 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.87■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 KCNA6P17658 529 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 ZMYND15Q9H091 742 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 IL16Q14005 1332 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 SSFA2P28290 1259 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 RICTORQ6R327 1708 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 F6X3S4 739 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 IFT172Q9UG01 1749 aa16.83■□□□□ 0.29
HERC5-201ENST00000264350 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 SLC4A2P04920 1241 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 RBM25P49756 843 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 ZFYVE9O95405 1425 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 PKNOX2Q96KN3 472 aa16.82■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 PSME1Q06323 249 aa16.82■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 PKP1Q13835 747 aa16.82■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.82■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.82■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.81■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.81■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 DIP2BQ9P265 1576 aa16.81■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.81■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.8■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 ADGRB2O60241 1585 aa16.8■□□□□ 0.28
HERC5-201ENST00000264350 GCC1Q96CN9 775 aa16.8■□□□□ 0.28
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