RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 ATP7BP35670 1465 aa23.04■■□□□ 1.28
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PRDM12-201ENST00000253008 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.03■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.03■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.03■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 CPS1P31327 1500 aa23.03■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 NUTM2FA1L443 756 aa23.02■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.02■■□□□ 1.28
PRDM12-201ENST00000253008 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF853P0CG23 659 aa23.01■■□□□ 1.27
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PRDM12-201ENST00000253008 KRT24Q2M2I5 525 aa23■■□□□ 1.27
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PRDM12-201ENST00000253008 ARXQ96QS3 562 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM12-201ENST00000253008 IFT57Q9NWB7 429 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM12-201ENST00000253008 DLC1Q96QB1 1528 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM12-201ENST00000253008 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.99■■□□□ 1.27
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PRDM12-201ENST00000253008 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.97■■□□□ 1.27
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PRDM12-201ENST00000253008 ZNF428Q96B54 188 aa22.93■■□□□ 1.26
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PRDM12-201ENST00000253008 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.92■■□□□ 1.26
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PRDM12-201ENST00000253008 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PRDM12-201ENST00000253008 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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PRDM12-201ENST00000253008 HSCBQ8IWL3 235 aa22.9■■□□□ 1.26
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PRDM12-201ENST00000253008 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.89■■□□□ 1.26
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PRDM12-201ENST00000253008 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.88■■□□□ 1.25
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PRDM12-201ENST00000253008 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.84■■□□□ 1.25
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PRDM12-201ENST00000253008 FOXO3O43524 673 aa22.82■■□□□ 1.24
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PRDM12-201ENST00000253008 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.81■■□□□ 1.24
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PRDM12-201ENST00000253008 C3P01024 1663 aa22.8■■□□□ 1.24
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PRDM12-201ENST00000253008 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
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PRDM12-201ENST00000253008 TNRQ92752 1358 aa22.77■■□□□ 1.24
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.77■■□□□ 1.24
PRDM12-201ENST00000253008 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PRDM12-201ENST00000253008 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PRDM12-201ENST00000253008 MEIS3Q99687 375 aa22.77■■□□□ 1.24
PRDM12-201ENST00000253008 SIRT1Q96EB6 747 aa22.76■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 DCTPP1Q9H773 170 aa22.76■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.76■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 AKAP12Q02952 1782 aa22.75■■□□□ 1.23
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