RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.58■■■□□ 2.17
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ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.55■■■□□ 2.16
ANKRD54-201ENST00000215941 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.55■■■□□ 2.16
ANKRD54-201ENST00000215941 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.54■■■□□ 2.16
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ANKRD54-201ENST00000215941 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa28.48■■■□□ 2.15
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ANKRD54-201ENST00000215941 CFAP44Q96MT7 982 aa28.47■■■□□ 2.15
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ANKRD54-201ENST00000215941 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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ANKRD54-201ENST00000215941 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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ANKRD54-201ENST00000215941 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.34■■■□□ 2.13
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ANKRD54-201ENST00000215941 IFT57Q9NWB7 429 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD54-201ENST00000215941 GNAI1P63096 354 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-201ENST00000215941 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-201ENST00000215941 NFE2L2Q16236 605 aa28.27■■■□□ 2.12
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ANKRD54-201ENST00000215941 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 ITSN1Q15811 1721 aa28.25■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.24■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 NASPP49321 788 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 AKAP12Q02952 1782 aa28.24■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPRUQ92729 1446 aa28.23■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 BAG4O95429 457 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ANKRD54-201ENST00000215941 NME9Q86XW9 330 aa28.23■■■□□ 2.11
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