RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051454.3

Fam171b-201, Transcript of Protein FAM171B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fam171b, Length 5,614 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Trim29Q8R2Q0 587 aa20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mical1Q8VDP3 1048 aa20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tpm2P58774 284 aa20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map3k13Q1HKZ5 959 aa20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tpm4Q6IRU2 248 aa20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pik3c2gO70167 1506 aa20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Camsap2Q8C1B1 1461 aa20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rhot2Q8JZN7 620 aa20.45■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ripk4Q9ERK0 786 aa20.44■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 BccipQ9CWI3 316 aa20.44■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Abcc2Q8VI47 1543 aa20.43■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 MycnP03966 462 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cers3Q1A3B0 383 aa20.42■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 CastP51125 788 aa20.42■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccdc155Q80VJ8 648 aa20.42■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gcc1Q9D4H2 778 aa20.42■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nek4Q9Z1J2 792 aa20.42■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ssh2Q5SW75 1423 aa20.41■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Srgap3Q812A2 1099 aa20.41■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slc12a5Q91V14 1138 aa20.41■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa20.41■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 InsrP15208 1372 aa20.41■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa20.41■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slf2Q6P9P0 1278 aa20.4■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Synj2Q9D2G5 1434 aa20.4■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cfap69Q8BH53 942 aa20.4■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rec8Q8C5S7 591 aa20.39■□□□□ 0.86
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Riok1Q922Q2 567 aa20.39■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ddx58Q6Q899 926 aa20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cfap99A0A140LIX9 648 aa20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mum1Q6DID5 682 aa20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cadps2Q8BYR5 1297 aa20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ppp4r3bQ922R5 820 aa20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa20.38■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ak7Q9D2H2 614 aa20.37■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Smarcc1P97496 1104 aa20.37■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Kiaa0753Q6A000 959 aa20.37■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 TbcaP48428 108 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ifit1bl2Q3U687 466 aa20.35■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cspp1B2RX88 1205 aa20.35■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 AU015836B2RUM3 263 aa20.35■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Kif3aP28741 701 aa20.35■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Naip5Q9R016 1403 aa20.34■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 MvpQ9EQK5 861 aa20.34■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa20.34■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rapgef3Q8VCC8 918 aa20.33■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 PtprgQ05909 1442 aa20.33■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 NinlQ6ZQ12 1394 aa20.33■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tpm1P58771 284 aa20.33■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rabep1O35551 862 aa20.33■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tmem132eQ6IEE6 982 aa20.33■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hook1Q8BIL5 728 aa20.33■□□□□ 0.85
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rfx1P48377 963 aa20.33■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cep131Q62036 1060 aa20.33■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Bicd2Q921C5 820 aa20.33■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 March6Q6ZQ89 909 aa20.32■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Prr29B1ARI9 187 aa20.31■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sel1lQ9Z2G6 790 aa20.31■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 PzpQ61838 1495 aa20.31■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ankle2Q6P1H6 964 aa20.31■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa20.31■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 FosbP13346 338 aa20.3■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 RdxP26043 583 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ginm1Q91WR6 327 aa20.3■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Adcy10Q8C0T9 1614 aa20.3■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ptch1Q61115 1434 aa20.3■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Qtrt2B8ZXI1 415 aa20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Myd88P22366 296 aa20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Irf9Q61179 399 aa20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slain2Q8CI08 581 aa20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 GpkowQ56A08 488 aa20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dnajc10Q9DC23 793 aa20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hfm1D3Z4R1 1434 aa20.29■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa20.28■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Asxl2Q8BZ32 1370 aa20.28■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Soga3Q6NZL0 945 aa20.28■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa20.28■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slc7a3P70423 618 aa20.28■□□□□ 0.84
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gabpb2P81069 414 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms