RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640507.1

SPIN3-240, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-240ENST00000640507 MUSKO15146 869 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SDC3O75056 442 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PEX11BO96011 259 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 DGKAP23743 735 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SERPINA4P29622 427 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SCNN1BP51168 640 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 BCL2L1Q07817 233 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CFAP58Q5T655 872 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CNGA4Q8IV77 575 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 DOCK9Q9BZ29 2069 aa15.95■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PIAS2O75928 621 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CD48P09326 243 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 C1SP09871 688 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CDK4P11802 303 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 AP1S1P61966 158 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 MMRN1Q13201 1228 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 FZD2Q14332 565 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PDK2Q15119 407 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ERAP2Q6P179 960 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SARM1Q6SZW1 724 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 KCTD6Q8NC69 237 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CFAP69A5D8W1 941 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TOR1BO14657 336 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CSF2P04141 144 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 KRT7P08729 469 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CR2P20023 1033 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 MAN1A1P33908 653 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TAS2R40P59535 323 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 YPEL5P62699 121 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 DPYSL3Q14195 570 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 AGERQ15109 404 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 BBS5Q8N3I7 341 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ZNF670Q9BS34 389 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 UCKL1Q9NWZ5 548 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.94■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 A0A1W2PQ67 120 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 NEMP2A6NFY4 417 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TRIM38O00635 465 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 GIMD1P0DJR0 217 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 CKMT2P17540 419 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 IGFALSP35858 605 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ACADVLP49748 655 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 DNAJC3Q13217 504 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PTK2BQ14289 1009 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ZNF235Q14590 738 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 HS1BP3Q53T59 392 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 MARC1Q5VT66 337 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PARGQ86W56 976 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 OR4C6Q8NH72 309 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SPOCK2Q92563 424 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 MGME1Q9BQP7 344 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 TRIM5Q9C035 493 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.93■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 H3BM21 787 aa15.92■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SCAMP1O15126 338 aa15.92■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 SIGLEC6O43699 453 aa15.92■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 RFPL3O75679 317 aa15.92■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 C6P13671 934 aa15.92■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 GJC1P36383 396 aa15.92■□□□□ 0.14
SPIN3-240ENST00000640507 MMP12P39900 470 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms