RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525		E7ENX8	843 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525		H0Y626	953 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	STRN	O43815	780 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM16	O95361	564 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC2A3	P11169	496 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	NCK1	P16333	377 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PIM3	Q86V86	326 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	OXSM	Q9NWU1	459 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM114	B3SHH9	223 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	DPYSL4	O14531	572 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	NRP2	O60462	931 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A6	P19224	532 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PROZ	P22891	400 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	RGS2	P41220	211 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PPIL2	Q13356	520 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	FIG4	Q92562	907 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	EMCN	Q9ULC0	261 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	HMX2	A2RU54	273 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	FZD9	O00144	591 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	GRIK3	Q13003	919 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ABLIM1	O14639	778 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	AURKA	O14965	403 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM189A1	O60320	539 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	USP46	P62068	366 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	11.84	□□□□□ -0.51	7e-6	■■■■■ 27.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525		H3BMM5	538 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525		H3BSA7	217 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-223	ENST00000639525	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51

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