RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	THPO	P40225	353 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CLCN5	P51795	746 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	P2RX3	P56373	397 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	OLR1	P78380	273 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	ST3GAL1	Q11201	340 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CAPS	Q13938	189 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	VEPH1	Q14D04	833 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CCNG2	Q16589	344 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	DCAF6	Q58WW2	860 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	DLK2	Q6UY11	383 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175		Q6ZSV7	163 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM199	Q8N511	208 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	NGEF	Q8N5V2	710 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	GPT2	Q8TD30	523 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	APOLD1	Q96LR9	279 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	MAP7D2	Q96T17	732 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	ITPA	Q9BY32	194 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	NUF2	Q9BZD4	464 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	ABI3	Q9P2A4	366 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	MKLN1	Q9UL63	735 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF521	Q96K83	1311 aa		3.21	□□□□□ -1.89
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PRG0	241 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC53	A6NM62	1247 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175		B4DGG1	531 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	MS4A18	H0YCH9	400 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SPRY3	O43610	288 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	CCNDBP1	O95273	360 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	MLYCD	O95822	493 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	CHAT	P28329	748 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SHMT1	P34896	483 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	CASP2	P42575	452 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	RFX2	P48378	723 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	PLCD1	P51178	756 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	RUNX2	Q13950	521 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	GPR18	Q14330	331 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	HNF4G	Q14541	408 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SHB	Q15464	509 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SGO1	Q5FBB7	561 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	NOXA1	Q86UR1	476 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	PIM3	Q86V86	326 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	FBXL8	Q96CD0	374 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	HMCES	Q96FZ2	354 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	BBS4	Q96RK4	519 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	ASAH2	Q9NR71	780 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	RNF7	Q9UBF6	113 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	TTC36	A6NLP5	189 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	BECN2	A8MW95	431 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	WNT9B	O14905	357 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SEC14L5	O43304	696 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	RGS14	O43566	566 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	ATP2C2	O75185	946 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	PTP4A3	O75365	173 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	MMP2	P08253	660 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	SPARC	P09486	303 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	ACADM	P11310	421 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	ETFA	P13804	333 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	TM4SF1	P30408	202 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATRX-223	ENST00000637175	MAPK4	P31152	587 aa		3.2	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms