RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627490.2

PBX1-222, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PBX1, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-222ENST00000627490 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 LRGUKQ96M69 825 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CDRT15Q96T59 188 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 IGLV3-25P01717 112 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 AMHP03971 560 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 EPHA3P29320 983 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ADRA1AP35348 466 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 POLE2P56282 527 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 FOLH1Q04609 750 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 ART3Q13508 389 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PEX6Q13608 980 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PSMD5Q16401 504 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TAC4Q86UU9 113 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 KDM1BQ8NB78 822 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 RNF34Q969K3 372 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 TOP1MTQ969P6 601 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PLK2Q9NYY3 685 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.34■□□□□ 0.85
PBX1-222ENST00000627490 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 GABRB3P28472 473 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 CD151P48509 253 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 PSMD8P48556 350 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 IKBKEQ14164 716 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 HIPK4Q8NE63 616 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 NUF2Q9BZD4 464 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 WDR41Q9HAD4 459 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 XPR1Q9UBH6 696 aa20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 NEMP1O14524 444 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 EFCAB14O75071 495 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 THOP1P52888 689 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 DSC1Q08554 894 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 UPP1Q16831 310 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 FAM171BQ6P995 826 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 GALNT7Q86SF2 657 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 METTL23Q86XA0 190 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 TMEM199Q8N511 208 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 CALML6Q8TD86 181 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 RCN3Q96D15 328 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 ACBD6Q9BR61 282 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 UBP1Q9NZI7 540 aa20.32■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 POMCP01189 267 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 ODC1P11926 461 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 GSTT1P30711 240 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 DLG1Q12959 904 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 NXNQ6DKJ4 435 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 EDEM1Q92611 657 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 FICDQ9BVA6 458 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 TREX1Q9NSU2 369 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 NEU3Q9UQ49 428 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 H0YJX3 145 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 TRIM38O00635 465 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 VAPBO95292 243 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 ITGB8P26012 769 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 CLCNKBP51801 687 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 SLC12A2P55011 1212 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 STX5Q13190 355 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 MANEALQ5VSG8 457 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 CHSY3Q70JA7 882 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 AGR3Q8TD06 166 aa20.31■□□□□ 0.84
PBX1-222ENST00000627490 FATE1Q969F0 183 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms