RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 B8ZZF3 427 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 IGSF6O95976 241 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA2BP08514 1039 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 HK3P52790 923 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOAP61586 193 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD51Q06609 339 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG11Q2TAA5 492 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC81Q6ZN84 652 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PYROXD2Q8N2H3 581 aa25.92■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 COL26A1Q96A83 441 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 NTAN1Q96AB6 310 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC74AQ96AQ1 378 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 DOLKQ9UPQ8 538 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa25.91■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 PTP4A2Q12974 167 aa25.91■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM52BQ4KMG9 183 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 HID1Q8IV36 788 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 HMCESQ96FZ2 354 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC2Q96KP1 924 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.91■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC14Q15048 493 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 MED8Q96G25 268 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 EPB41L5Q9HCM4 733 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 LHX3Q9UBR4 397 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TENM4Q6N022 2769 aa25.9■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 PLD2O14939 933 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 EFSO43281 561 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 KRT3P12035 628 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHB2P29323 1055 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 ENPP7Q6UWV6 458 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 RD3Q7Z3Z2 195 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa25.89■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 D6RAR5 112 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHB6O15197 1021 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RASA4O43374 803 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGRP1O95267 797 aa25.88■■□□□ 1.73
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CAPNS1-211ENST00000590874 GPD1P21695 349 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 XPAP23025 273 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ELP6Q0PNE2 266 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 NFATC4Q14934 902 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 CYTH1Q15438 398 aa25.88■■□□□ 1.73
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CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN11A1L157 253 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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CAPNS1-211ENST00000590874 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A5P35504 534 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX5P35711 763 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 JAM2P57087 298 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SERINC3Q13530 473 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP5AQ14642 412 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR59Q6PJI9 974 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB11FIP2Q7L804 512 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 APOOQ9BUR5 198 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOOQ9BVL4 669 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.87■■□□□ 1.73
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