RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C5orf22Q49AR2 442 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRMD7Q6ZUT3 714 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF354CQ86Y25 554 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RTKNQ9BST9 563 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TET1Q8NFU7 2136 aa16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRCA2P51587 3418 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FKBP6O75344 327 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMBSP08397 361 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR1E1P30953 314 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC11A1P49279 550 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AP2B1P63010 937 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPNMBQ14956 572 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TECRLQ5HYJ1 363 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NADSYN1Q6IA69 706 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AAGABQ6PD74 315 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACAD11Q709F0 780 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEX13Q92968 403 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OLFM1Q99784 485 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDH22Q9UJ99 828 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD36A6QL64 1941 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HTTP42858 3142 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 H7C4K7 107 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRAMEF11O60813 436 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRT34O76011 436 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANPEPP15144 967 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TACR2P21452 398 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSHL1Q14406 222 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RTP2Q5QGT7 225 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA6LQ8N4H0 392 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDM1BQ8NB78 822 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAET1EQ8TD07 263 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC126Q96EE4 140 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDNQ99608 321 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACSS2Q9NR19 701 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDYLQ9Y232 598 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BPTFQ12830 3046 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GBF1Q92538 1859 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LDB2O43679 373 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TLR5O60602 858 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPOP01588 193 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THRAP10827 490 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIK3R1P27986 724 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPHA3P29320 983 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACVRL1P37023 503 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GATMP50440 423 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PFKPQ01813 784 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACVR1Q04771 509 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CUL3Q13618 768 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LAMB3Q13751 1172 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FEM1CQ96JP0 617 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF599Q96NL3 588 aa16.6■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms