RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 NTSR1P30989 418 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 IL12RB1P42701 662 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 WASP42768 502 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PSMD8P48556 350 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CSNK1DP48730 415 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PLTPP55058 493 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 WNT3AP56704 352 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CDK16Q00536 496 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CDK18Q07002 472 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MESP2Q0VG99 397 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CDH17Q12864 832 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CYTH1Q15438 398 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 HIF1AQ16665 826 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 DUPD1Q68J44 220 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CENPUQ71F23 418 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SRLQ86TD4 932 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CCDC25Q86WR0 208 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CACUL1Q86Y37 369 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PDIK1LQ8N165 341 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 PGBD5Q8N414 524 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CNTD1Q8N815 330 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF366Q8N895 744 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 CPT1BQ92523 772 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 RMDN1Q96DB5 314 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FEM1CQ96JP0 617 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NELL2Q99435 816 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 FMO2Q99518 471 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 NOD2Q9HC29 1040 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 UBP1Q9NZI7 540 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.65□□□□□ -1.34
CTDNEP1-204ENST00000570484 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 K7EQS6 105 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DCXO43602 365 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SIN3BO75182 1162 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ALDH1A2O94788 518 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMEM63AO94886 807 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CD160O95971 181 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 IL1BP01584 269 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC4A1P02730 911 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FGF1P05230 155 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 UGT2B4P06133 528 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ACADMP11310 421 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CR2P20023 1033 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 TNFRSF8P28908 595 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RGRP47804 291 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GRIA4P48058 902 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CCINQ13939 588 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SEPT6Q14141 434 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GALNT3Q14435 633 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KCNJ11Q14654 390 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 MYLK3Q32MK0 819 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 ERAP2Q6P179 960 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 CASC4Q6P4E1 433 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 USP45Q70EL2 814 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.64□□□□□ -1.35
CTDNEP1-204ENST00000570484 STK40Q8N2I9 435 aa6.64□□□□□ -1.35
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