RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567954.5

LYRM1-208, Transcript of LYR motif containing 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYRM1, Length 460 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM1-208	ENST00000567954	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954		Q6ZVU0	165 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	RNF31	Q96EP0	1072 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	TNIP3	Q96KP6	325 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	STMN3	Q9NZ72	180 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	AKAP6	Q13023	2319 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954		H7C1Q1	480 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	WNT7A	O00755	349 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	TSPAN6	O43657	245 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	BNIP3L	O60238	219 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CTAG2	O75638	210 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	PRNP	P04156	253 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CA5A	P35218	305 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	NEK3	P51956	506 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	VAV2	P52735	878 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CASP6	P55212	293 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CDC16	Q13042	620 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	NR5A1	Q13285	461 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	BIRC2	Q13490	618 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	KCNAB1	Q14722	419 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	MYBPC3	Q14896	1274 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	POSTN	Q15063	836 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CHSY3	Q70JA7	882 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	BRF1	Q92994	677 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	RNF34	Q969K3	372 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SGSM3	Q96HU1	749 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	KL	Q9UEF7	1012 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23	7e-14	■■■■■ 51.9
LYRM1-208	ENST00000567954		K7ENM7	598 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	RNF103	O00237	685 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	FAM200B	P0CF97	657 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ADRB3	P13945	408 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CCDC130	P13994	396 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CD19	P15391	556 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ABCD1	P33897	745 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	TNNC1	P63316	161 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	GTF2B	Q00403	316 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CBLB	Q13191	982 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC12A1	Q13621	1099 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	IL11RA	Q14626	422 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF174	Q15697	407 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	VPS36	Q86VN1	386 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ATL2	Q8NHH9	583 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	TNFRSF25	Q93038	417 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	INTS13	Q9NVM9	706 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LYRM1-208	ENST00000567954	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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