RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558258.1

AC009558.2-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009558.2, Length 396 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009558.2-201ENST00000558258 HNF1BP35680 557 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC16A2P36021 539 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CCT5P48643 541 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TMPRSS3P57727 454 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 PPATQ06203 517 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ANKRD1Q15327 319 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 RPE65Q16518 533 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 MANEAQ5SRI9 462 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM71Q6P5X7 295 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CPXCR1Q8N123 301 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 PELI3Q8N2H9 469 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM199Q8N511 208 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM174Q8WUU8 243 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 IFT27Q9BW83 186 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 MROH8Q9H579 483 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM160Q9NX00 188 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 NLKQ9UBE8 527 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 KIF13BQ9NQT8 1826 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.01□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 HBP1O60381 514 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TMCC1O94876 653 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 POLBP06746 335 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 UBE3AQ05086 875 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 PTGR1Q14914 329 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TWIST1Q15672 202 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 USP38Q8NB14 1042 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ENGASEQ8NFI3 743 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 STAMQ92783 540 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa5□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 DLEC1Q9Y238 1755 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CACNA1FO60840 1977 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM247A6NEH6 219 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 H0YGN5 161 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 H3BNX3 289 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CLDN7O95471 211 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CBX6O95503 412 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 BMP15O95972 392 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ADAP00813 363 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 WEE2P0C1S8 567 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TNNT1P13805 278 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 PPP2R1AP30153 589 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 POLD2P49005 469 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CLCNKBP51801 687 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 SELENOVP59797 346 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 KRTAP10-11P60412 298 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CHRNDQ07001 517 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TAF12Q16514 161 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ME3Q16798 604 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ATG16L1Q676U5 607 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 DPP10Q8N608 796 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 NCSTNQ92542 709 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ZBTB9Q96C00 473 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 KLHL31Q9H511 634 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 TASP1Q9H6P5 420 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 FZD3Q9NPG1 666 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CDH22Q9UJ99 828 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 HSF4Q9ULV5 492 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 RAP2CQ9Y3L5 183 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 SQORQ9Y6N5 450 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 NRXN2Q9P2S2 1712 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 OR6C68A6NDL8 312 aa4.98□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 STRNO43815 780 aa4.98□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 CHRNB2P17787 502 aa4.98□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 MAPK9P45984 424 aa4.98□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 P2RX3P56373 397 aa4.98□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.98□□□□□ -1.61
AC009558.2-201ENST00000558258 RALBP1Q15311 655 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms