RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557685.5

EFCAB11-213, Transcript of EF-hand calcium binding domain 11, human

TSL 3

Gene EFCAB11, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFCAB11-213	ENST00000557685	RASSF2	P50749	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CLCN5	P51795	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	HDAC4	P56524	1084 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRAME	P78395	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	LPIN1	Q14693	890 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	MED22	Q15528	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685		Q5PR19	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	COG5	Q9UP83	839 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	MTA2	O94776	668 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	RARG	P13631	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CHRNB2	P17787	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TM4SF1	P30408	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	ME1	P48163	572 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CDH12	P55289	794 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CAPS	Q13938	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CRYM	Q14894	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SHB	Q15464	509 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	HSPB2	Q16082	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	DUSP6	Q16828	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	MMP21	Q8N119	569 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	NME8	Q8N427	588 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	LHPP	Q9H008	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EFCAB11-213	ENST00000557685	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685		A0A1W2PQF6	199 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	CHL1	O00533	1208 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	VILL	O15195	856 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	ATP2C2	O75185	946 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	NDUFB8	O95169	186 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	EPN2	O95208	641 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	CLDN7	O95471	211 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	TFPI	P10646	304 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	AGA	P20933	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	DCTD	P32321	178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	PPP3CC	P48454	512 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	GRIK3	Q13003	919 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	CUL4A	Q13619	759 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EFCAB11-213	ENST00000557685	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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