RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556700.5

NUMB-222, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 4

Gene NUMB, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-222	ENST00000556700	SCAMP1	O15126	338 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	ALOX15B	O15296	676 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	SLC28A2	O43868	658 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	PRLR	P16471	622 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	CDC25B	P30305	580 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	RAB6C	Q53S08	254 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	TC2N	Q8N9U0	490 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	KLK6	Q92876	244 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	CHP1	Q99653	195 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	DNAI1	Q9UI46	699 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NUMB-222	ENST00000556700		A0A1W2PQU0	124 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	FAM72C	H0Y354	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NEBL	O76041	1014 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PROSC	O94903	275 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CTSL	P07711	333 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	KRT7	P08729	469 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	MAN1A1	P33908	653 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CSRP3	P50461	194 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CLDN2	P57739	230 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CLN3	Q13286	438 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	KRT81	Q14533	505 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	DLG2	Q15700	870 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PARP15	Q460N3	678 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NLRP14	Q86W24	1093 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	FAM72B	Q86X60	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	BMF	Q96LC9	184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PSMB7	Q99436	277 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	MYOC	Q99972	504 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PREB	Q9HCU5	417 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	THSD1	Q9NS62	852 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	KLF15	Q9UIH9	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700		A0A0D9SEW6	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SNAP91	O60641	907 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SRC	P12931	536 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SERPINB6	P35237	376 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ARHGAP25	P42331	645 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	MAGEA1	P43355	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	HCAR3	P49019	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ODF2	Q5BJF6	829 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	HSPH1	Q92598	858 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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