RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556216.5

CGRRF1-204, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CGRRF1, Length 1,827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-204ENST00000556216 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.95□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.95□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 A8MX80 341 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 C1QTNF9P0C862 333 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 GRK6P43250 576 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 RXRGP48443 463 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ZNF75DP51815 510 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 DNAJC3Q13217 504 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 SGCGQ13326 291 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 CCDC157Q569K6 752 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 GLRX5Q86SX6 157 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 SLC25A45Q8N413 288 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 CENPTQ96BT3 561 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 PSKH2Q96QS6 385 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 KLF15Q9UIH9 416 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TSPAN11A1L157 253 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 DFNA5O60443 496 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 CR2P20023 1033 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 CSNK1DP48730 415 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 GBE1Q04446 702 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 OVGP1Q12889 678 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 IHHQ14623 411 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 PTPRRQ15256 657 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 GPR27Q9NS67 375 aa14.94□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TNNT1P13805 278 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 KDELR1P24390 212 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 IGFALSP35858 605 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 CLDN6P56747 220 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 FZD2Q14332 565 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 NOD2Q9HC29 1040 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 SEPT3Q9UH03 358 aa14.93□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 A0A0U1RQS6 177 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 A6NNZ2 444 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 MAGEC1O60732 1142 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TM7SF2O76062 418 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 SERPINA4P29622 427 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 MAN1A1P33908 653 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 SERPINB6P35237 376 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 LIG3P49916 1009 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 BCL2L1Q07817 233 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ZNF235Q14590 738 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 RFFLQ8WZ73 363 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 FAF2Q96CS3 445 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ZNF599Q96NL3 588 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 SMIM14Q96QK8 99 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ZNF670Q9BS34 389 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TRIM38O00635 465 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 FPGTO14772 594 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 TNFSF14O43557 240 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 NEBLO76041 1014 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 MTA2O94776 668 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 KRT7P08729 469 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 GIMD1P0DJR0 217 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 MYF5P13349 255 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 C6P13671 934 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 DGKAP23743 735 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 MMP12P39900 470 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 MMP13P45452 471 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 PFN3P60673 137 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 GALNT2Q10471 571 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 RALGDSQ12967 914 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 PDK2Q15119 407 aa14.92□□□□□ -0.02
CGRRF1-204ENST00000556216 LLGL1Q15334 1064 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms