RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	MAML1	Q92585	1016 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT35	Q92764	455 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TSGA13	Q96PP4	275 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	POM121B	A6NF01	834 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	APOL1	O14791	398 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PJA2	O43164	708 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT10	P13645	584 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CCNC	P24863	283 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SERPINA4	P29622	427 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	AKT2	P31751	481 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	CDKN2B	P42772	138 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	VAV2	P52735	878 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DYNLT1	P63172	113 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	BCL2L1	Q07817	233 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAF2	Q12933	501 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TAZ	Q16635	292 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	IQCH	Q86VS3	1027 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	OR13H1	Q8NG92	308 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SKA1	Q96BD8	255 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	BMF	Q96LC9	184 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	LGMN	Q99538	433 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TPCN1-223	ENST00000552985	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	MATN3	O15232	486 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CBFA2T3	O75081	653 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	THEGL	P0DJG4	465 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CEACAM1	P13688	526 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CCNB1	P14635	433 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	MMP12	P39900	470 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CCT8	P50990	548 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SUOX	P51687	545 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	DSC2	Q02487	901 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ADCY2	Q08462	1091 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	RALGDS	Q12967	914 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SGCG	Q13326	291 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP58	Q5T655	872 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TPCN1-223	ENST00000552985	FATE1	Q969F0	183 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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