RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 SFNP31947 248 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 GSTM5P46439 218 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ANTXR2P58335 489 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PMP22Q01453 160 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SPAG1Q07617 926 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 RAPSNQ13702 412 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 IDI1Q13907 227 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 GALNT3Q14435 633 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 IQCB1Q15051 598 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ZMYND11Q15326 602 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 DPYSL2Q16555 572 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SGCBQ16585 318 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CCDC142Q17RM4 750 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CRB2Q5IJ48 1285 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TCTE1Q5JU00 501 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CD276Q5ZPR3 534 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SLC9A4Q6AI14 798 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SPRED2Q7Z698 418 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PROSER1Q86XN7 944 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TIGD4Q8IY51 512 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CFAP206Q8IYR0 622 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 MMP21Q8N119 569 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 FAM133AQ8N9E0 248 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 BANPQ8N9N5 519 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PDZD8Q8NEN9 1154 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 OR8K3Q8NH51 312 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 C17orf50Q8WW18 174 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TEKT4Q8WW24 435 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 MYLIPQ8WY64 445 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SLAMF9Q96A28 289 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TMEM186Q96B77 213 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SAMD8Q96LT4 415 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 WDR92Q96MX6 357 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TOX2Q96NM4 488 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SSX3Q99909 188 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SEMA3CQ99985 751 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 G6PC3Q9BUM1 346 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ZNF350Q9GZX5 532 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CLPBQ9H078 707 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 RNF32Q9H0A6 362 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 EPB41L4BQ9H329 900 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TUFT1Q9NNX1 390 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ERAP1Q9NZ08 941 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 RCE1Q9Y256 329 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SIT1Q9Y3P8 196 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 ACEP12821 1306 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PQF6 199 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 H0Y8G0 127 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 PER2O15055 1255 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 LDLRAD4O15165 306 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CETN3O15182 167 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CS-232ENST00000552331 CLDN3O15551 220 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms