RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 PRKCGP05129 697 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ITGB6P18564 788 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 GABRB2P47870 512 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 HK3P52790 923 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 YPEL5P62699 121 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ELOCQ15369 112 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 COLEC12Q5KU26 742 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 MANEAQ5SRI9 462 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 KLC2Q9H0B6 622 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 OR12D3Q9UGF7 316 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SPTA1P02549 2419 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TERTO14746 1132 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TMCC1O94876 653 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PCCBP05166 539 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CYP11B1P15538 503 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TBR1Q16650 682 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 BNIPLQ7Z465 357 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 NLRP14Q86W24 1093 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 USP7Q93009 1102 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 STARD5Q9NSY2 213 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 HPCAL4Q9UM19 191 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.28■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 MMEP08473 750 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ALPIP09923 528 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 LIPCP11150 499 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ADRA1BP35368 520 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 INPP5AQ14642 412 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 LRRC14Q15048 493 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 NAA35Q5VZE5 725 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 GKN2Q86XP6 184 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CCNJLQ8IV13 435 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PLPP6Q8IY26 295 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 CCDC185Q8N715 623 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 HTR3CQ8WXA8 447 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PDXPQ96GD0 296 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 TBATAQ96M53 351 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 APOOQ9BUR5 198 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 KLQ9UEF7 1012 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.27■□□□□ 0.2
CS-227ENST00000551441 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 RAMP2O60895 175 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 LRIG2O94898 1065 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 RASGRP1O95267 797 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 RHOQP17081 205 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 BLKP51451 505 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 RHOAP61586 193 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 NFATC4Q14934 902 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 CLCA4Q14CN2 919 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 CAMK4Q16566 473 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 PHF19Q5T6S3 580 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 MANEALQ5VSG8 457 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 GPT2Q8TD30 523 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 TMEM74Q96NL1 305 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 MAGEH1Q9H213 219 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 RWDD2AQ9UIY3 292 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 NEU3Q9UQ49 428 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 PTPN13Q12923 2485 aa16.26■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 B4DGG1 531 aa16.25■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 C9orf172C9J069 976 aa16.25■□□□□ 0.19
CS-227ENST00000551441 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms