RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 TLK1Q9UKI8 766 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-216ENST00000550632 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-216ENST00000550632 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP15-216ENST00000550632 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.96□□□□□ -0.01
USP15-216ENST00000550632 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 AREL1O15033 823 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 LDLRP01130 860 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TNFP01375 233 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 UGT2B4P06133 528 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 PAEPP09466 180 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 SLC2A3P11169 496 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 HTR1BP28222 390 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CD1CP29017 333 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 NADK2Q4G0N4 442 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 BEND5Q7L4P6 421 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 MOCOSQ96EN8 888 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 APOOQ9BUR5 198 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 SPRY4Q9C004 299 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 MPP6Q9NZW5 540 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 KCND3Q9UK17 655 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 KCTD3Q9Y597 815 aa14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 E5RJQ4 531 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 KRIT1O00522 736 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CUTAO60888 179 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ZMPSTE24O75844 475 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 FURINP09958 794 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 F8A1P23610 371 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 PEX5P50542 639 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 LIMK2P53671 638 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CDK17Q00537 523 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 MC1RQ01726 317 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ENPEPQ07075 957 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 NME3Q13232 169 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 INPP5AQ14642 412 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 LRRC14Q15048 493 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TTC7BQ86TV6 843 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TMEM135Q86UB9 458 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 DEFB106AQ8N104 65 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 KAT5Q92993 513 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 VOPP1Q96AW1 172 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 RTP4Q96DX8 246 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 WDR92Q96MX6 357 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.94□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TOR1BO14657 336 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 GRAP2O75791 330 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 DNAJB5O75953 348 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 SYT1P21579 422 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CSF2RBP32927 897 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 GPD2P43304 727 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ARF5P84085 180 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ERV3-1Q14264 604 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 NFIL3Q16649 462 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 C5orf22Q49AR2 442 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 PAGE5Q96GU1 130 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CEP44Q9C0F1 390 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 LUZP4Q9P127 313 aa14.93□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 TMEM202A6NGA9 273 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 PPP6R2O75170 966 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 RFPL1O75677 317 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 PCCBP05166 539 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 DPYDQ12882 1025 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 STILQ15468 1287 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 RETSATQ6NUM9 610 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 MARVELD3Q96A59 401 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP15-216ENST00000550632 CYP4F12Q9HCS2 524 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms