RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PLD4	Q96BZ4	506 aa		15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	C2orf78	A6NCI8	922 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	EFCAB14	O75071	495 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	STC2	O76061	302 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	BPGM	P07738	259 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	LYN	P07948	512 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	MMP2	P08253	660 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TYK2	P29597	1187 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	GMPR	P36959	345 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ETFB	P38117	255 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	DSC2	Q02487	901 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	STX3	Q13277	289 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	RAPH1	Q70E73	1250 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PGBD5	Q8N414	524 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	DCLK2	Q8N568	766 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP2A3	Q93084	1043 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ITFG2	Q969R8	447 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ARMC5	Q96C12	935 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	YME1L1	Q96TA2	773 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	VPS45	Q9NRW7	570 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		15.83	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0D9SEW6	157 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	E2F8	A0AVK6	867 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193		F8W8V4	182 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PRAMEF11	O60813	436 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNA4	P22459	653 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS6KA3	P51812	740 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	IHH	Q14623	411 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PPM1J	Q5JR12	505 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	HIPK4	Q8NE63	616 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	KIAA0355	O15063	1070 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	EPHB1	P54762	984 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	AP2B1	P63010	937 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GBP5	Q96PP8	586 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SNX15	Q9NRS6	342 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	GLRA3	O75311	464 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PDE5A	O76074	875 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	VAPB	O95292	243 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ABCG1	P45844	678 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CDH4	P55283	916 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CDC16	Q13042	620 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PEX6	Q13608	980 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM199	Q8N511	208 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	ISL2	Q96A47	359 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		15.82	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A088AWK7	358 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193		H3BNC9	293 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	IRF1	P10914	325 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGEA12	P43365	314 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	PPP3CC	P48454	512 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIM4	Q9C037	500 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGEH1	Q9H213	219 aa		15.81	■□□□□ 0.12
GRSF1-208	ENST00000545193	EBF3	Q9H4W6	596 aa		15.81	■□□□□ 0.12

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms