RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 CD48P09326 243 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ARSEP51690 589 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TAS2R40P59535 323 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM52BQ4KMG9 183 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 HS1BP3Q53T59 392 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 BMFQ96LC9 184 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 PCDH12Q9NPG4 1184 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 HAUS2Q9NVX0 235 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.21■■□□□ 1.63
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TM7SF3-212ENST00000543088 ANKRD36A6QL64 1941 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 A0A1W2PQ67 120 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 POM121BA6NF01 834 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 MMP20O60882 483 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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TM7SF3-212ENST00000543088 IL4RP24394 825 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 BNIP3Q12983 259 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 MARC1Q5VT66 337 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 EID2Q8N6I1 236 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 PNPLA1Q8N8W4 532 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 GPR27Q9NS67 375 aa25.2■■□□□ 1.62
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TM7SF3-212ENST00000543088 MFSD11O43934 449 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 SDC3O75056 442 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 MMP13P45452 471 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 RALGPS1Q5JS13 557 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 SLCO6A1Q86UG4 719 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 PARGQ86W56 976 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CPNE8Q86YQ8 564 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 TC2NQ8N9U0 490 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ECHDC3Q96DC8 303 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 NUDCD1Q96RS6 583 aa25.19■■□□□ 1.62
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TM7SF3-212ENST00000543088 SCUBE2Q9NQ36 999 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 H3BM21 787 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 TOR1BO14657 336 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ENC1O14682 589 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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TM7SF3-212ENST00000543088 PEX11BO96011 259 aa25.18■■□□□ 1.62
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TM7SF3-212ENST00000543088 MMP12P39900 470 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 THOP1P52888 689 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 PTK2BQ14289 1009 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ODF2Q5BJF6 829 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 PCDH19Q8TAB3 1148 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CENPTQ96BT3 561 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 MGME1Q9BQP7 344 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 DNAJC28Q9NX36 388 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 TOR4AQ9NXH8 423 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 KLK13Q9UKR3 277 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 MSRB2Q9Y3D2 182 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CHD8Q9HCK8 2581 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 SHROOM3Q8TF72 1996 aa25.18■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ITIH2P19823 946 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC1A1P43005 524 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 YPEL5P62699 121 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 GALNT2Q10471 571 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 FAF2Q96CS3 445 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRD1A4D1F6 860 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CFAP69A5D8W1 941 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF487B1APH4 448 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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TM7SF3-212ENST00000543088 ALPPL2P10696 532 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CDK4P11802 303 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 C6P13671 934 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 CR2P20023 1033 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 MX2P20592 715 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 IGFALSP35858 605 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF75DP51815 510 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 PFN3P60673 137 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC14Q15048 493 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-212ENST00000543088 TCEAL1Q15170 157 aa25.16■■□□□ 1.62
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