RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD36A6QL64 1941 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 LMO7DNF2Z398 122 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 YPEL5P62699 121 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 SYCP1Q15431 976 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 GLMNQ92990 594 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC46A1Q96NT5 459 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR70Q9NW82 654 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 FZD10Q9ULW2 581 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 DOLKQ9UPQ8 538 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 CFAP46Q8IYW2 2715 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 RPIAP49247 311 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 SERINC3Q13530 473 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 WSCD2Q2TBF2 565 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM52BQ4KMG9 183 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF605Q86T29 641 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 C3orf20Q8ND61 904 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 MCEEQ96PE7 176 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 ATMQ13315 3056 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 LRP4O75096 1905 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CALB1P05937 261 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 TPM2P07951 284 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 PLA2G2AP14555 144 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 PDX1P52945 283 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC14Q15048 493 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ALG11Q2TAA5 492 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 KCTD16Q68DU8 428 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 MON1BQ7L1V2 547 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 KYQ8NBH2 561 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 SEMA4CQ9C0C4 833 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDH12Q9NPG4 1184 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 DKK3Q9UBP4 350 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 OR1A2Q9Y585 309 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF462Q96JM2 2506 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 J3KR12 359 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ERVH48-1M5A8F1 160 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 AGRPO00253 132 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 TNFSF15O95150 251 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 C6P13671 934 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CTSEP14091 401 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 UCNP55089 124 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 SPIDRQ14159 915 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 LY6DQ14210 128 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 NEK11Q8NG66 645 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 SUV39H2Q9H5I1 410 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 PCCBP05166 539 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT10P13645 584 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 HK3P52790 923 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 OGDHQ02218 1023 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 VAC14Q08AM6 782 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 INPP5AQ14642 412 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSWIM9Q86XI8 627 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CAMK1DQ8IU85 385 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 NAT6Q93015 286 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC74AQ96AQ1 378 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 AGPAT1Q99943 283 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 APOOQ9BUR5 198 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 DPH1Q9BZG8 443 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 TCEA3O75764 348 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 RGRP47804 291 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 LIG3P49916 1009 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 CCL7P80098 99 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 RHDQ02161 417 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 ELP6Q0PNE2 266 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 UGP2Q16851 508 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-205ENST00000527952 PARP15Q460N3 678 aa24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms