RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525809.5

BBS1-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 601 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-208	ENST00000525809	NAT6	Q93015	286 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	HIC2	Q96JB3	615 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	MCEE	Q96PE7	176 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	LGMN	Q99538	433 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	BOC	Q9BWV1	1114 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	THSD1	Q9NS62	852 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PADI4	Q9UM07	663 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TSPAN11	A1L157	253 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	CFAP69	A5D8W1	941 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	DAPK3	O43293	454 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PRAMEF11	O60813	436 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TCEA3	O75764	348 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ALPI	P09923	528 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	CTSE	P14091	401 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TSHR	P16473	764 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	UCN	P55089	124 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TPI1	P60174	286 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ELOC	Q15369	112 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	STX1A	Q16623	288 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	CFAP58	Q5T655	872 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	APOO	Q9BUR5	198 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	DPH1	Q9BZG8	443 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	LRRC19	Q9H756	370 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	GULP1	Q9UBP9	304 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	LHX3	Q9UBR4	397 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	MYO6	Q9UM54	1294 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ADAMTS20	P59510	1910 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809		J3KR12	359 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	MUSK	O15146	869 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PALM	O75781	387 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	RASGRP1	O95267	797 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PIGN	O95427	931 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TNF	P01375	233 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PSMA2	P25787	234 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	HK3	P52790	923 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	CXADR	P78310	365 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	OGDH	Q02218	1023 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	MAMLD1	Q13495	774 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	INPP5A	Q14642	412 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	NFATC4	Q14934	902 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	NCAPH	Q15003	741 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	AGER	Q15109	404 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	IRF4	Q15306	451 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	SRL	Q86TD4	932 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	GKN2	Q86XP6	184 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	HID1	Q8IV36	788 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	LRRC61	Q9BV99	259 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	CLPB	Q9H078	707 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PDF	Q9HBH1	243 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		10.4	□□□□□ -0.74
BBS1-208	ENST00000525809	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-208	ENST00000525809	PTPRB	P23467	1997 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-208	ENST00000525809	SPEG	Q15772	3267 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-208	ENST00000525809	PLXNA2	O75051	1894 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-208	ENST00000525809	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-208	ENST00000525809	CAPN8	A6NHC0	703 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-208	ENST00000525809	KLK10	O43240	276 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-208	ENST00000525809	RNF8	O76064	485 aa		10.39	□□□□□ -0.75
BBS1-208	ENST00000525809	GZMA	P12544	262 aa		10.39	□□□□□ -0.75

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