RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519975.1

PCMTD1-204, Transcript of protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1, human

TSL 2

Gene PCMTD1, Length 995 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCMTD1-204	ENST00000519975	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	ZNF263	O14978	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	PGRMC2	O15173	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	TXNL1	O43396	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	CEP104	O60308	925 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	TADA2A	O75478	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	TPPP	O94811	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	DDAH2	O95865	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	TPM2	P07951	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	MGAT1	P26572	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	CXCR5	P32302	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	MCM5	P33992	734 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	CCR3	P51677	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	ZNF132	P52740	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	GAD1	Q99259	594 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	SPX	Q9BT56	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PCMTD1-204	ENST00000519975	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975		A6NL46	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CA12	O43570	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SPRY2	O43597	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	HS6ST1	O60243	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	AVIL	O75366	819 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ERCC2	P18074	760 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PTPN3	P26045	913 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PON1	P27169	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CASP3	P42574	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	GPC3	P51654	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	F2RL1	P55085	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CAPS	Q13938	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	RUNX2	Q13950	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCMTD1-204	ENST00000519975	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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