RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519254.2

CLN8-204, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-204ENST00000519254 GDI1P31150 447 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 DSC2Q02487 901 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PDGFRLQ15198 375 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MROH9Q5TGP6 573 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PACS1Q6VY07 963 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MTSS1LQ765P7 747 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 RASSF3Q86WH2 238 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 HLA-CQ95604 372 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TADA1Q96BN2 335 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 APOPT1Q96IL0 206 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ZNF778Q96MU6 729 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 HPS4Q9NQG7 708 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MARK1Q9P0L2 795 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 VPS51Q9UID3 782 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 EBAG9O00559 213 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TRIM24O15164 1050 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TM9SF1O15321 606 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ECI2O75521 394 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CCNFP41002 786 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CD86P42081 329 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ITKQ08881 620 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ZNF235Q14590 738 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PCID2Q5JVF3 399 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 RNF43Q68DV7 783 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ECT2Q9H8V3 914 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 GGA2Q9UJY4 613 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 EYSQ5T1H1 3165 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MUSKO15146 869 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ADRA1DP25100 572 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CNTFP26441 200 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CHRNA4P43681 627 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ARF5P84085 180 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 HTR4Q13639 388 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 POU6F1Q14863 301 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PCSK7Q16549 785 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 FUT11Q495W5 492 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 HHATQ5VTY9 493 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 C12orf40Q86WS4 652 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ALG14Q96F25 216 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ZNF599Q96NL3 588 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 VPS45Q9NRW7 570 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ZFATQ9P243 1243 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ETV4P43268 484 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 RUNX3Q13761 415 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 PDK4Q16654 411 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CPA6Q8N4T0 437 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 LMLNQ96KR4 655 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 AGAP2Q99490 1192 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CCDC78A2IDD5 438 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 GJB3O75712 270 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 ZMPSTE24O75844 475 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 SLC6A11P48066 632 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 DGKGP49619 791 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 KDSRQ06136 332 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.6□□□□□ -0.07
CLN8-204ENST00000519254 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms