RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 TPSB2P20231 275 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PCYT1AP49585 367 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CDK7P50613 346 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TPSAB1Q15661 275 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ARCQ7LC44 396 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NPWQ8N729 165 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MCUQ8NE86 351 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 E2F7Q96AV8 911 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CERS2Q96G23 380 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 YME1L1Q96TA2 773 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 THAP1Q9NVV9 213 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SELENONQ9NZV5 590 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 STOML1Q9UBI4 398 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CFL2Q9Y281 166 aa7.93□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 A8MUI8 341 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 F5H5T6 163 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP33O14559 1287 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TM9SF1O15321 606 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TSPAN3O60637 253 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ADAM23O75077 832 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 DCTN3O75935 186 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RAG1P15918 1043 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TAC1P20366 129 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 FOXN2P32314 431 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 AVPR1AP37288 418 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 VHLP40337 213 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 GLRBP48167 497 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SLC11A1P49279 550 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CXCR3P49682 368 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 OCRLQ01968 901 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RALGDSQ12967 914 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA5AQ13591 1074 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC6Q16204 474 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CDONQ4KMG0 1287 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00523Q86TU6 105 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TDRPQ86YL5 185 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 LGI2Q8N0V4 545 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 LZTR1Q8N653 840 aa7.92□□□□□ -1.14
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TRPS1-208ENST00000519076 SERAC1Q96JX3 654 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 VAT1Q99536 393 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.92□□□□□ -1.14
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TRPS1-208ENST00000519076 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 E9PAM4 449 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PMLP29590 882 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RASSF2P50749 326 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 BLVRAP53004 296 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 EPHB1P54762 984 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CAP1Q01518 475 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 STX3Q13277 289 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 LAPTM5Q13571 262 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PDK4Q16654 411 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 KCNMB4Q86W47 210 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 EXT2Q93063 718 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CIB1Q99828 191 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.92□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 OR6C75A6NL08 312 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 M0QZQ0 153 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 SYN3O14994 580 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 KRT75O95678 551 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 CRYZL1O95825 349 aa7.91□□□□□ -1.14
TRPS1-208ENST00000519076 PCNAP12004 261 aa7.91□□□□□ -1.14
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